MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 chromosome

Total Repeats: 91787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017641	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612164
2	NC_017641	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	386612164
3	NC_017641	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	386612164
4	NC_017641	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	386612164
5	NC_017641	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612164
6	NC_017641	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612164
7	NC_017641	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	386612164
8	NC_017641	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612164
9	NC_017641	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612164
10	NC_017641	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	386612164
11	NC_017641	ACT	2	6	794	799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612164
12	NC_017641	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612164
13	NC_017641	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612164
14	NC_017641	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612164
15	NC_017641	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612164
16	NC_017641	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	386612164
17	NC_017641	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612164
18	NC_017641	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	386612164
19	NC_017641	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612164
20	NC_017641	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612164
21	NC_017641	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612164
22	NC_017641	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612164
23	NC_017641	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	386612164
24	NC_017641	TGC	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612164
25	NC_017641	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612164
26	NC_017641	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612164
27	NC_017641	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	386612164
28	NC_017641	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612164
29	NC_017641	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612164
30	NC_017641	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612164
31	NC_017641	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612164
32	NC_017641	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612164
33	NC_017641	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612164
34	NC_017641	CAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612164
35	NC_017641	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	386612164
36	NC_017641	GCG	2	6	1837	1842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612164
37	NC_017641	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612164
38	NC_017641	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612164
39	NC_017641	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612164
40	NC_017641	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	386612164
41	NC_017641	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612164
42	NC_017641	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612164
43	NC_017641	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612164
44	NC_017641	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612164
45	NC_017641	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612164
46	NC_017641	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612164
47	NC_017641	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612164
48	NC_017641	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612164
49	NC_017641	TGG	2	6	2422	2427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612164
50	NC_017641	ATTGAA	2	12	2430	2441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386612164
51	NC_017641	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612164
52	NC_017641	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612164
53	NC_017641	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	386612164
54	NC_017641	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612164
55	NC_017641	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612164
56	NC_017641	TGCC	2	8	2594	2601	0 %	25 %	25 %	50 %	386612164
57	NC_017641	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612164
58	NC_017641	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612165
59	NC_017641	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612165
60	NC_017641	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612165
61	NC_017641	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	386612165
62	NC_017641	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612165
63	NC_017641	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	386612165
64	NC_017641	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612165
65	NC_017641	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612165
66	NC_017641	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612165
67	NC_017641	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612165
68	NC_017641	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612165
69	NC_017641	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	386612165
70	NC_017641	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612165
71	NC_017641	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612165
72	NC_017641	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	386612165
73	NC_017641	CTGG	2	8	3418	3425	0 %	25 %	50 %	25 %	386612165
74	NC_017641	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	386612165
75	NC_017641	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612165
76	NC_017641	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	386612165
77	NC_017641	TCCGGC	2	12	3577	3588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386612165
78	NC_017641	TG	3	6	3605	3610	0 %	50 %	50 %	0 %	386612165
79	NC_017641	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612165
80	NC_017641	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	386612166
81	NC_017641	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	386612166
82	NC_017641	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612166
83	NC_017641	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612166
84	NC_017641	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	386612166
85	NC_017641	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612166
86	NC_017641	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612166
87	NC_017641	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612166
88	NC_017641	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612166
89	NC_017641	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	386612166
90	NC_017641	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612166
91	NC_017641	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612166
92	NC_017641	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612166
93	NC_017641	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612166
94	NC_017641	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612166
95	NC_017641	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612166
96	NC_017641	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612166
97	NC_017641	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612166
98	NC_017641	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	386612166
99	NC_017641	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612166
100	NC_017641	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612166
101	NC_017641	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612166
102	NC_017641	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612166
103	NC_017641	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612167
104	NC_017641	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612167
105	NC_017641	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612167
106	NC_017641	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612167
107	NC_017641	CCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612167
108	NC_017641	CCA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386612167
109	NC_017641	CTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386612167
110	NC_017641	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612167
111	NC_017641	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612167
112	NC_017641	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612168
113	NC_017641	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386612168
114	NC_017641	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612168
115	NC_017641	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612168
116	NC_017641	CAGT	2	8	5765	5772	25 %	25 %	25 %	25 %	386612168
117	NC_017641	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386612168
118	NC_017641	TCA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612168
119	NC_017641	TTC	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612168
120	NC_017641	TTC	2	6	5911	5916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612168
121	NC_017641	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386612168
122	NC_017641	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612168
123	NC_017641	TTG	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612168
124	NC_017641	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612168
125	NC_017641	AAATCG	2	12	6151	6162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386612168
126	NC_017641	AGCG	2	8	6269	6276	25 %	0 %	50 %	25 %	386612168
127	NC_017641	CTG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612168
128	NC_017641	GTG	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612168
129	NC_017641	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612169
130	NC_017641	GGC	2	6	6569	6574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612169
131	NC_017641	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612169
132	NC_017641	GTT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612169
133	NC_017641	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612169
134	NC_017641	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612169
135	NC_017641	CGC	2	6	7101	7106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612169
136	NC_017641	TGCCGC	2	12	7107	7118	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386612169
137	NC_017641	CGC	2	6	7203	7208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612169
138	NC_017641	GCC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612169
139	NC_017641	GCCA	2	8	7226	7233	25 %	0 %	25 %	50 %	386612169
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143	NC_017641	AGA	2	6	7679	7684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612169
144	NC_017641	CGG	2	6	7700	7705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612169
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146	NC_017641	CAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612169
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148	NC_017641	A	6	6	7945	7950	100 %	0 %	0 %	0 %	386612169
149	NC_017641	GCAT	2	8	7955	7962	25 %	25 %	25 %	25 %	386612169
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151	NC_017641	CAAC	2	8	8334	8341	50 %	0 %	0 %	50 %	386612170
152	NC_017641	TC	3	6	8345	8350	0 %	50 %	0 %	50 %	386612170
153	NC_017641	CGCAG	2	10	8359	8368	20 %	0 %	40 %	40 %	386612170
154	NC_017641	TTGA	2	8	8387	8394	25 %	50 %	25 %	0 %	386612170
155	NC_017641	CAG	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612170
156	NC_017641	CG	3	6	8432	8437	0 %	0 %	50 %	50 %	386612170
157	NC_017641	CAG	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612170
158	NC_017641	CGAC	2	8	8454	8461	25 %	0 %	25 %	50 %	386612170
159	NC_017641	TGC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612170
160	NC_017641	AAG	2	6	8679	8684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612170
161	NC_017641	CTG	2	6	8705	8710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612170
162	NC_017641	TTG	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612170
163	NC_017641	AAGA	2	8	8810	8817	75 %	0 %	25 %	0 %	386612170
164	NC_017641	AGA	2	6	8830	8835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612170
165	NC_017641	TAC	2	6	8870	8875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612170
166	NC_017641	CTG	2	6	8978	8983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612170
167	NC_017641	GCTG	2	8	8989	8996	0 %	25 %	50 %	25 %	386612170
168	NC_017641	GCA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612170
169	NC_017641	A	6	6	9165	9170	100 %	0 %	0 %	0 %	386612170
170	NC_017641	CTG	2	6	9182	9187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612170
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174	NC_017641	ATC	2	6	9461	9466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612171
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241	NC_017641	AAG	2	6	12949	12954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612175
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251	NC_017641	TGC	2	6	13480	13485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612175
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253	NC_017641	AGA	2	6	13651	13656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612175
254	NC_017641	CTT	2	6	13669	13674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612175
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256	NC_017641	GAA	2	6	13812	13817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612175
257	NC_017641	GAC	2	6	13839	13844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612175
258	NC_017641	ACTG	2	8	13865	13872	25 %	25 %	25 %	25 %	386612175
259	NC_017641	CAG	2	6	13968	13973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612175
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262	NC_017641	TGT	2	6	14036	14041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612175
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381	NC_017641	AAT	2	6	20917	20922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386612181
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385	NC_017641	GC	3	6	21063	21068	0 %	0 %	50 %	50 %	386612181
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389	NC_017641	TAT	2	6	21211	21216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612181
390	NC_017641	ATT	2	6	21262	21267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612181
391	NC_017641	TTG	3	9	21268	21276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612181
392	NC_017641	AT	3	6	21286	21291	50 %	50 %	0 %	0 %	386612181
393	NC_017641	TTG	2	6	21341	21346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612181
394	NC_017641	ATC	2	6	21415	21420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612181
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423	NC_017641	A	7	7	23429	23435	100 %	0 %	0 %	0 %	386612183
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431	NC_017641	TTG	2	6	24119	24124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612185
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499	NC_017641	GGC	2	6	28228	28233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386612187
500	NC_017641	ACG	2	6	28305	28310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612187

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